La comunidad de Hermanas Misioneras de la Santísima Trinidad se encontraba ubicada en el barrio Torices calle Bogotá; por iniciativa de Monseñor Rubén Izasa Restrepo en ese entonces arzobispo de Cartagena, y después de haber hecho un compromiso de venta con él de un terreno con los salones que había construidos. La comunidad de Hermanas Misioneras de la Santísima Trinidad, se trasladan al Barrio San Fernando en el mes de Julio del año de 1977. Se instalan en la casa parroquial.
Cabe anotar que en ese entonces el barrio no tenía templo y la Eucaristía se celebraba en un pasillo grande, la parroquia era asistida por padres salesianos. Las hermanas inician su trabajo de evangelización desplazándose a visitar todas las familias invitándolas a participar de los actos litúrgicos, la gente correspondía prestando interés en los encuentros por este motivo se dio inicio a las asambleas, visitas a enfermos, grupos juveniles catequesis etc. Realizando estos apostolados la Madre Margarita sintió la necesidad de fundar un colegio orientado y dirigido por las Hermanas.
El Colegio fue fundado el 22 de Noviembre de 1.977 bajo la orientación de la comunidad de Hermanas Misioneras de la Santísima Trinidad con el propósito de fundar una unidad educativa denominada Colegio Trinitario en honor a la Santísima Trinidad. Luego de ser adaptadas sus instalaciones se inicia con el grado primero y progresivamente se fueron aumentando los grados.
La dirección del colegio la ejerce la Madre Margarita Montoya hasta el año de 1987. Y luego nuevamente el año de 1992.
El 21 de Abril de 1978 por medio de la Resolución N° 024 se le concede permiso de fundación y el 03 de Diciembre de 1982, por medio de la Resolución N° 21354 se aprueban los estudios correspondientes de 1° a 5° del nivel de educación básica primaria. El 28 de Noviembre de 1991 por medio de la Resolución N° 3885 se obtiene la licencia para la iniciación de los grados A y B del nivel de educación preescolar. Luego el 26 de agosto de 1994 mediante Resolución N° 1677 nuevamente se aprueban los estudios de 1° a 5° de educación básica primaria. En Noviembre de 1998, se obtiene la aprobación del preescolar y renovación de legalización de estudios de primaria mediante Resolución N° 0365 de Noviembre 17 de 1998.
El 30 de Marzo del año 2006 se le concede reconocimiento oficial a los estudios de los Niveles de Educación Preescolar y Básica: Ciclo Primaria y Secundaria, mediante Resolución # 0423. El 03 de Diciembre del año 2007 se le concede reconocimiento oficial a los estudios de los Niveles de Educación Preescolar, Básica y Media Académica, mediante Resolución # 4330.
En el año de 1988 hasta el 1991 hermana Orfidia Osorio González ejerce la dirección.
En el año de 1993 hasta el año de 1996 la señora Luz María Pérez toma la dirección del colegio.
En el año 1997 hasta el año 2006 ejerce la dirección la señora María Graciela Quintero Álzate.
En el año 2007 Flor Delis Giraldo Giraldo.
Ante muchos obstáculos y bajo la petición de padres de familia que pedían ampliar la cobertura de la básica que permitiera continuar y fomentar la filosofía de la institución, surge en el año 2002 el grado 6° implementándose progresivamente grado por grado.
En el año 2008 proclamamos la primera promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel medio.
En el año 2009 la segunda promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel alto.
En el año 2010 la tercera promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel superior.
En el año 2011 la cuarta promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel superior.
En el año 2012 la quinta promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel alto.
En el año 2013 la sexta promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel alto.
En el año 2014 entregamos la séptima promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel B.
En el año 2015 la octava promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel A.
En el año 2016 la novena promoción, la cual en el Icfes quedo en el nivel A.
En el año 2017 la décima promoción, la cual en el icfes quedo en el nivel A
